Олеся Колмакова — лауреат премии банка МФК 2013 года

Колмакова Олеся Владимировна, аспирант 2-го года обучения Института фундаментальной биологии и биотехнологии СФУ, работает над диссертационным исследованием «Определение видового состава бактерий бассейна реки Енисей молекулярно-генетическими методами и экспериментальное исследование их биогеохимических функций в водных экосистемах».

Цель работы — исследование видового состава и экосистемной роли бактериопланктона в социально-значимых водоемах Красноярского края. В ходе работы была проведена серия экспериментов для определения органических субстратов, утилизируемых свободноживущим бактериопланктоном. Применение результатов исследований позволит создать математические модели функционирования водных экосистем для рационального управления ими, в том числе для прогнозирования последствий антропогенного воздействия на водные экосистемы.

Научно-технические достижения в 2013 году

Экспериментальное исследование биогеохимических функций гетеротрофного бактериопланктона в водных экосистемах

В вегетационный период (май – сентябрь) поставлено 5 экспериментов в микроэкосистемах с добавками лизина в разных концентрациях в воду эвтрофного водохранилища Бугач. Отобраны пробы на численность и состав бактериопланктона, концентрацию растворённого лизина (ежедневно), численность и состав зоопланктона, фитопланктона, концентрацию лизина в сестоне (в первый и последний день эксперимента).

Определение видового состава бактерий бассейна реки Енисей молекулярно-генетическими методами

Определена нуклеотидная последовательность ампликонов гена 16S рибосомной РНК бактерий реки Енисей и её притоков методом секвенирования следующего поколения (NGS) и проведена предварительная обработка полученных данных. В настоящее время осваивается программное обеспечение QIIME для биоинформатического анализа микробных сообществ по данным высокопроизводительного секвенирования ампликонов 16S рРНК.

Публикации

Колмакова О. В. Современные методы определения видоспецифичных биогеохимических функций бактериопланктона. 2013. Журнал Сибирского федерального университета. Т. 6. № 1.

Конкурсы

III место на Научной сессии молодых учёных и аспирантов Института биофизики СО РАН, Красноярск.
Победитель Конкурса по организации участия студентов, аспирантов и молодых учёных во всероссийских, международных конференциях и научных мероприятиях Красноярского краевого фонда поддержки научной и научно-технической деятельности.

Конференции

Выступление с устным докладом на V International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology — BioMicroWorld2013, Мадрид, Испания, 2–4 октября.
Выступление с устным докладом на XV Школе-конференции молодых учёных «Биология внутренних вод», Борок, 19–24 октября. Материалы конференции (Колмакова О. В., Трусова М. Ю. Потребление аминокислот некультивируемым бактериопланктоном эвтрофного водохранилища / Биология внутренних вод: Материалы XV Школы-конференции молодых учёных / Кострома.

Победы в конкурсах и конференциях в 2012–2013 гг.

I место на Научной сессии молодых учёных и аспирантов Института биофизики СО РАН, Красноярск, 2012.
Победитель отборочного тура Всероссийского конкурса научно-исследовательских работ среди студентов и аспирантов в области биологических наук, Ульяновск, 2012.
Победитель Конкурса по организации участия студентов, аспирантов и молодых учёных во всероссийских, международных конференциях и научных мероприятиях Красноярского краевого фонда поддержки научной и научно-технической деятельности, 2012.
III место на Научной сессии молодых учёных и аспирантов Института биофизики СО РАН, Красноярск, 2013.

Наиболее значимые публикации в 2011–2013 гг.

Kolmakova O. V., Trusova M. Yu. Uptake of Amino Acids by Uncultivated Bacterioplankton of a Eutrophic Water Reservoir. Contemporary Problems of Ecology. 2011. Vol. 18. № 1. P. 8–14.
Trusova M. Yu., Kolmakova O. V., Gladyshev M. I. Seasonal features of consumption of lysine by uncultivated bacterial plankton of eutrophic water reservoir. Contemporary Problems of Ecology. 2012. Vol. 5. No. 4. P. 391–398.
Колмакова О. В. Современные методы определения видоспецифичных биогеохимических функций бактериопланктона. 2013. Журнал Сибирского федерального университета. Т. 6. № 1 (принято в печать).